Notre troisième atelier méthodologique aura lieu le 6 juin de 10h à 12h30 puis de 14h à 17h salle 115 de l’UTES dans l’Atrium et sera animé par Christophe Desterke.
Au programme :
- L’objectif de cet enseignement est d’apprendre à compiler un package R avec le code source de son modèle mathématique. La compilation du code source sous forme de package R permet de figer les versions de son modèle mathématique avec les dépendances nécessaires au calcul, améliorant la reproductibilité de calcul.
- Les packages R compilés sont compatibles multiplateforme donc ils peuvent faire l’objet d’une large redistribution d’autant plus qu’ils sont open source.
- La publication de vos packages R sur la plateforme Github permet de valoriser et de référencer votre travail et donc potentiellement d’augmenter la valeur de vos publications scientifiques.
Enseignement dirigé d’une journée : au cours de la matinée mise en place de l’environnement de programmation sous Windows et introduction à la programmation fonctionnelle R ; après-midi : compilation d’un exemple de package R. Publication sur Github.
Inscription par mail à BioSys.SU@gmail.com.
